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基因的Transcript Variant 和 isoform有什么区别

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解决时间 2021-02-13 21:37
基因的Transcript Variant 和 isoform有什么区别
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基因的Transcript Variant 和 isoform的区别如下:
1. transcript variant是从结果来看的,一个基因产生了不同的mRNA;splice variant是从过程讲的,强调内含子剪切的方式不一样。
2. variant指的是转录本的亚型,而isform指的是蛋白水平的。有的时候虽然variant很多但是对应的蛋白可能是重复的。
3. 有很多过程可以影响isoform的形成,如可变剪切,即不一定所有的外显子都用来形成成熟的mRNA,而且有时候什么内含子,外显子也不是绝对的。另外有RNA editing这个过程,会使得形成mRNA时某个特定的位置的碱基发生变化,也就是变成不是原来基因想要编码的东西。
4. 有个例子就是一个叫XBP-1的转录因子,它调控细胞的unfolded protein response,激活方式就是上游蛋白剪切其mRNA然后生成有活性的mRNA,所以这种variant的生成竟然也是调控的一种方法。
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Isoforms refers to different versions of protein from the same gene in this setting, and transcript variants refers to different versions of mRNA transcript from the same gene.
trscript variant和isoform有时混用。但实际上,意义上应当有所不同。
基因的Transcript Variant 和 isoform的区别如下: transcript variant是从结果来看的,一个基因产生了不同的mRNA;splice variant是从过程讲的,强调内含子剪切的方式不一样。 variant指的是转录本的亚型,而isform指的是蛋白水平的。有的时候虽然variant很多但是对应的蛋白可能是重复的。 有很多过程可以影响isoform的形成,如可变剪切,即不一定所有的外显子都用来形成成熟的mRNA,而且有时候什么内含子,外显子也不是绝对的。另外有RNA editing这个过程,会使得形成mRNA时某个特定的位置的碱基发生变化,也就是变成不是原来基因想要编码的东西。 有个例子就是一个叫XBP-1的转录因子,它调控细胞的unfolded protein response,激活方式就是上游蛋白剪切其mRNA然后生成有活性的mRNA,所以这种variant的生成竟然也是调控的一种方法
基因的Transcript Variant 和 isoform的区别如下: transcript variant是从结果来看的,一个基因产生了不同的mRNA;splice variant是从过程讲的,强调内含子剪切的方式不一样。 variant指的是转录本的亚型,而isform指的是蛋白水平的。有的时候...
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