海关进口增值税专用缴款书电子版可以抵扣吗

货物放行后，正本缴款书需要20天左右才拿到，我可以用缴款书的电子版先去申报抵扣吗

不可以。
最好在缴款书日期后25个工作日之后才上传比对，并申请抵扣。

海关进口增值税专用缴款书上的注明税金可以抵扣，一般要先采集比对，比对通过的再申报抵扣；个别省市也有先抵扣，后比对的。