植物DNA能鉴定出具体是哪一棵植物上面的么？

就像人的DNA可以确定具体是哪个人的DNA
那么植物的DNA呢
我只知道植物的DNA可以确定具体是哪一种植物
那么可以具体到哪一棵植物么？

可以的，楼主的思路很好。
世界上任何一个个体的基因组DNA与另一个都是不同的，即使 是同卵双胞胎也不例外，因为，在生长的过程中会长生突变。
所以，只要把两种DNA提取出来，然后测序，通过对比就可以判断 是否是同一颗植物。
这样解释够清楚了吧！

我只知道微生物分类可以使用16S rDNA特异性来做，至于植物没有研究过。

理论上是可以的，可以确定到是哪一种植物，但定位到一棵是不行的（可能是同一棵母株无性繁殖繁殖的），而且一般不会这样去做的，成本太高了。