matlab程序在M文件中不能运行，但是在工作区间中能运行

正如题目所说，在M文件中运行后，就会出现Error: Missing variable or function.的错误，正常吗？

正常。如果你的函数要求有输入参数，你在m文件中运行是不会输入参数的，此时就会报错。比如
function func(t)
s = sin(t);
这个简单的m文件，在m文件中运行肯定会报错。
但是在matlab窗口，假设你已经有t这个变量。输入：
func(t)
回车，就正确。

文件名称不要设为数字，否则运行不出来正确结果。