三代测序细菌基因组图有哪些文献解读

答案:2 悬赏:80

解决时间 2021-11-26 20:24

提问者网友：王者刀枪不入
2021-11-26 08:09

三代测序细菌基因组图有哪些文献解读

最佳答案

二级知识专家网友：飘零作归宿
2021-11-26 09:19

三代对于DNA有两方面的要求，首先是DNA的量，一般对于Pacbio RSII的P6-C4建库测序方式对于一个样本的DNA量都要求10ug以上总量。此外DNA的质量值也对测序结果有很大影响。影响最大的还是DNA长度，原始DNA长度直接决定最后测序获得的sub_reads的读长。P6-C4可以获得长至30kb的reads，所以原始DNA最好长度至少大于10kb以上。
OD值一定程度上可以反映DNA的质量和纯度情况，如果DNA中含有如蛋白或盐离子甚至次生代谢物都会对Pacbio的测序产生影响。表现在测序数据量底下，甚至只有正常的十分之一数据。

全部回答

1楼网友：白日梦制造商
2021-11-26 10:26

如果不做精图的话，几百块钱就足够了。如果有相近菌株基因组可作参考的话，可以使用“逐次累进法基因组修正”策略来获得非常准确的基因组。该方法由中国科学家于2014年首创： iterative genome correction largely improves proteomic analysis of nonmodel organisms. journal of proteome research (2014), 13 (6), 2724–2734

我要举报

如以上问答内容为低俗、色情、不良、暴力、侵权、涉及违法等信息，可以点下面链接进行举报！