关于454焦磷酸测序的原理问题
答案:2 悬赏:0
解决时间 2021-01-24 06:53
- 提问者网友:我们很暧昧
- 2021-01-24 01:16
关于454焦磷酸测序的原理问题
最佳答案
- 二级知识专家网友:長槍戰八方
- 2021-01-24 02:11
1,对高通量测序来说,如果是测基因组相当于做鸟枪库测序,而不是针对特定位置来测得。
2,无法保证。所以实际上每次测一个基因组,其实要获得测至少6倍以上基因组大小的数据。通过过量的数据来拼接,最后再把仍然没解决的gap用一代测序cover掉。
3,理论上,是这样。一个接一个的进入。
4,我忘记454是几色萤光了。应该是单色,还需加入洗涤同步的时间,要远大于4at。ngs快不是指并不是每个循环快,而是每次获得的信息量大。ngs每次跑的时间要数倍于一代测序,但是获得的信息量要千倍于一代测序。如果想要大量数据,自然是ngs快的多。说它价钱便宜也是同样道理。
2,无法保证。所以实际上每次测一个基因组,其实要获得测至少6倍以上基因组大小的数据。通过过量的数据来拼接,最后再把仍然没解决的gap用一代测序cover掉。
3,理论上,是这样。一个接一个的进入。
4,我忘记454是几色萤光了。应该是单色,还需加入洗涤同步的时间,要远大于4at。ngs快不是指并不是每个循环快,而是每次获得的信息量大。ngs每次跑的时间要数倍于一代测序,但是获得的信息量要千倍于一代测序。如果想要大量数据,自然是ngs快的多。说它价钱便宜也是同样道理。
全部回答
- 1楼网友:一把行者刀
- 2021-01-24 03:06
一个一个回答吧。
1、每个磁珠携带的是同一个片段,经过乳液PCR过后,每个磁珠携带同一个片段的大量拷贝。但是LZ不要忘了,测序的时候是N多磁珠同时进行,不同的磁珠会携带不同的片段,不然怎么能称作高通量呢~
2、高通量测序结束之后都会进行组装,这涉及到生物信息学,这里头的算法俺也不懂,但是肯定会重新组合,不然谁把DNA打断建文库就弄死谁···
3、LZ的问题说到了454的缺陷:连续的同一个碱基怎么测序。这个是缺陷,只能通过荧光的强度来辨认,比如一个A和三个A的荧光强度就不同,不过这不好解决。
4、时间问题··额,这个LZ杞人忧天了,只能这么回答。
1、每个磁珠携带的是同一个片段,经过乳液PCR过后,每个磁珠携带同一个片段的大量拷贝。但是LZ不要忘了,测序的时候是N多磁珠同时进行,不同的磁珠会携带不同的片段,不然怎么能称作高通量呢~
2、高通量测序结束之后都会进行组装,这涉及到生物信息学,这里头的算法俺也不懂,但是肯定会重新组合,不然谁把DNA打断建文库就弄死谁···
3、LZ的问题说到了454的缺陷:连续的同一个碱基怎么测序。这个是缺陷,只能通过荧光的强度来辨认,比如一个A和三个A的荧光强度就不同,不过这不好解决。
4、时间问题··额,这个LZ杞人忧天了,只能这么回答。
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