怎样确定一个基因的功能
答案:1 悬赏:60
解决时间 2021-01-10 12:28
- 提问者网友:你挡着我发光了
- 2021-01-09 17:13
怎样确定一个基因的功能
最佳答案
- 二级知识专家网友:洒脱疯子
- 2021-01-09 17:31
首先看看你的这个基因是否在基因库里是否有相关类似的报道,然后进行功能鉴定,确定其是有什么样的个功能,是不是个完整的基因等.
回复
1, 首先确定是一个完整的基因,有上游完整的启动子序列,下游的终止序列.
2, 是否有明确的功能
3, 同源性比较:若有功能,同源性很高也算新基因.(看你自己的要求,不同物种相同功能的同源性很高但有差异也可以叫新基因. 单若有功能,并且同源性很低,那就是真正的新基因了!)
回复
首先要拿到 mRNA序列,最好是全序列。用RACE方法拿全长。然后对其表达 蛋白进行预测,选定最长的通读筐,将mRNA,蛋白进行库的序列对比,看是否有人已经报道。
从基因文库中预测蛋白二级结构,找其中的domain, 看时候有同源蛋白活则domain的报道。如果都没有,肯定是新基因。
从mRNA水平看其表达情况,看能否进行功能分析,可以做到的话,基因如果很重要,可以发到nature 或science文章的。
不过有很多地方是分开发文章,怕比人超越。
回复
我个人的一些体会
1、一定好好搜索数据库,如果和某个已知基因的相似性达到了百分之八、九十,新基因的结论就要慎重了。
2、一定要做个Southerm blot。
3、必须有比较充分的功能的证据,比如完整的读码框;Northern也证实有转录等。
回复
1, 首先确定是一个完整的基因,有上游完整的启动子序列,下游的终止序列.
2, 是否有明确的功能
3, 同源性比较:若有功能,同源性很高也算新基因.(看你自己的要求,不同物种相同功能的同源性很高但有差异也可以叫新基因. 单若有功能,并且同源性很低,那就是真正的新基因了!)
回复
首先要拿到 mRNA序列,最好是全序列。用RACE方法拿全长。然后对其表达 蛋白进行预测,选定最长的通读筐,将mRNA,蛋白进行库的序列对比,看是否有人已经报道。
从基因文库中预测蛋白二级结构,找其中的domain, 看时候有同源蛋白活则domain的报道。如果都没有,肯定是新基因。
从mRNA水平看其表达情况,看能否进行功能分析,可以做到的话,基因如果很重要,可以发到nature 或science文章的。
不过有很多地方是分开发文章,怕比人超越。
回复
我个人的一些体会
1、一定好好搜索数据库,如果和某个已知基因的相似性达到了百分之八、九十,新基因的结论就要慎重了。
2、一定要做个Southerm blot。
3、必须有比较充分的功能的证据,比如完整的读码框;Northern也证实有转录等。
我要举报
如以上问答内容为低俗、色情、不良、暴力、侵权、涉及违法等信息,可以点下面链接进行举报!
大家都在看
推荐资讯