户口不在农村，但是村里有宅基地。

村里重新测量宅基地证，说我家户口都不在农村，宅基地证可能不给批。

宅基地是批给村集体经济组织成员的，你们不属于该经济组织成员了，不给批宅基证的做法没有不妥。但你们如果有房产，可以与要该宅基的村民协商作价补偿。由于具体情况不明，上述回答仅供参考。