关于DNA序列在NCBI上比对的问题
答案:4 悬赏:0
解决时间 2021-02-15 15:05
- 提问者网友:神仙爷爷
- 2021-02-14 23:49
关于DNA序列在NCBI上比对的问题
最佳答案
- 二级知识专家网友:疯山鬼
- 2021-02-15 00:59
正链和反链不就是互补的吗,为什么你还要测两条链?似乎没有必要把,只要测定一条链就OK了。
把测出来的序列,粘贴到在NCBI上BLAST序列输入框中blast一下,得到比对的结果里头如果有完全配对的,看看这些完全配对的序列出自什么菌种(不能有两个菌种的序列和你的序列相同,如果相同,那么就不能作为鉴定菌种的特征序列了),并且查阅提交这个序列的相关文献。得到进一步的信息。
我说的步骤,只要你认真看NCBI的网页,你自己应该是可以操作下去的。
把测出来的序列,粘贴到在NCBI上BLAST序列输入框中blast一下,得到比对的结果里头如果有完全配对的,看看这些完全配对的序列出自什么菌种(不能有两个菌种的序列和你的序列相同,如果相同,那么就不能作为鉴定菌种的特征序列了),并且查阅提交这个序列的相关文献。得到进一步的信息。
我说的步骤,只要你认真看NCBI的网页,你自己应该是可以操作下去的。
全部回答
- 1楼网友:邪性洒脱
- 2021-02-15 04:09
而且,专业鉴定是不直接上NCBI对比的,你只是想知道是什么菌的话也根本不用测两端,测一端就够了。
- 2楼网友:厌今念往
- 2021-02-15 03:05
= =
如果你嫌麻烦,序列发给我,我帮你做好了。
如果你想知道具体的,我嫌打字麻烦 - -
- 3楼网友:陪我到地狱流浪
- 2021-02-15 01:29
用contig 1软件将上述两段序列拼接后,用拼接结果的反向互补序列进行blast。blast结果显示,你的菌株与动物乳杆菌,鼠乳杆菌,乳酸乳球菌max ident均为96%。
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