怎么查一个转录因子调控的下游基因

答案:2 悬赏:60

解决时间 2021-03-03 09:23

提问者网友：刀枪不入
2021-03-02 23:20

怎么查一个转录因子调控的下游基因

最佳答案

二级知识专家网友：时光不老我们不分离
2021-03-02 23:38

转录因子一半都结合在被调控基因的promoter区域，可以做一个chip-seq实验，然后在基因组数据库中定位这些与该转录因子结合的DNA区域.

　　那么这些区域的下游附近的基因就很可能是受该转录因子调控的基因。

　　然后在针对这些疑似基因做转录因子KO之后的该基因mRNA水平检测（realtimePCR）确定是否受其调控。

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1楼网友：偏爱自由
2021-03-03 00:59

在研究过程中我发现在min6细胞（beta细胞来源的肿瘤细胞）和肝细胞中高表达一种beta细胞特异性的转录因子（后简称x）后可以显著的提高glut-2基因的转录水平。目前x对glut-2基因有调控作用似乎并未见报道。但是现在还不能确定这种作用是直接的还是间接的。应该如何设计实验进行研究呢？恳请高人指点。恳请大家多多指教！1.是不是先要确定x和glut-2是能够结合的呢？这才是这个转录因子调控这个基因的直接证据啊实验方法有emsa和chip 2.证实了有结合，再用荧光素酶报告基因的方法来明确x究竟是结合在哪个位置你说的这个基因(人)的在

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