如何对含有简并碱基的序列设计引物

如何对含有简并碱基的序列设计引物

根据密码子的兼并性,常用一个符号代替某两个或者更多碱基。例如，编译丙氨酸的可以有4个密码子：GCU\GCC\GCA\GCG,这时生物学上为了方便，用字母N指代UCAG四个碱基，故说编译丙氨酸的密码子是GCN，其中N就是简并碱基。
通常生物学上根据蛋白质序列设计引物进行对应DNA克隆时，由于密码子的兼并性，对设计的引物上的某些碱基就会用简并碱基标示，在合成时各种碱基等量分配，也就是说，合成的简并引物是很多种引物的集合，其区别就在于简并碱基。