在柯南剧场版“世纪末的魔术师”中，小兰怀疑柯南是新一了？

我看到后半段小兰看见柯南推理的时候，那个眼神是怎么回事？她是不是怀疑柯南就是新一了？

还有看到柯南和灰原哀在一起说话的时候，小兰的眼神很忧郁，那是怎么回事？

首先，她就是怀疑了。而基德当时在假扮警部，他并没有掩盖新一也没有戳穿新一。只是因为柯南的推理那阵锋芒太露，引起了他的一种特别的注意。因为他也是智商很有高度的人啊。
其实，“看到柯南和灰原哀在一起说话的时候，小兰的眼神很忧郁”，不是因为特定是灰原哀，而是在内心里只要一假设新一就是柯南的话，那么他为什么不坦白自己，而是一再隐瞒和表演；他又经历了些什么？（做为新一的女友，她应该早有这方面的心理准备了。）只因为看到他柯南的身份很牢靠而感到复杂的感情吧。底子是心痛的。又飘着点担忧和惊恐。到底不是文艺片，其实没那么多感情内质让小兰提供给我们咂摸的啊。不过剧情对这种细节（小兰怀疑新一）又一次这样处理，是很值得人回味的。

你可能漏掉片尾曲后面的部分了,片尾曲后面还有一小段故事,是基德为报答柯南救鸽子而帮他了

什么怀疑嘛。就认为两个身份是同一个人。后来基德因为一只鸽子才帮柯南隐瞒过去的

我暂时保留我的看法！

是的，不过被基德帮忙掩盖了